Génétique équine: les robes, autres gènes

Pour ce dernier article concernant la génétique des robes, je vais aborder plusieurs gènes qui peuvent intervenir pour modifier la robe.

Gène Sooty

Source

On le note Sty et c'est un gène dominant. C'est un gène très peu connu, on ne sait pas encore s'il s'agit d'un seul gène ou d'un ensemble de plusieurs gènes ni même si le gène est identique sur les alezans ou les bais (base noire). 

Il génère un phénotype assez proche du dun ce qui le rend difficile à distinguer de ce dernier. Il agit en fonçant la robe de base et en ajoutant une fausse raie de mulet, des marbrures, des zones plus foncées...

Gène Flaxen

Source

On le note F. Il faut deux allèles F pour que le gène s'exprime. Si le cheval n'a qu'un allèle F, il sera simplement porteur du gène. F n'agit que sur l'alezan en éclaircissant les crins (parfois jusqu'au blanc). 

Pangaré/Seal brown

Source

On ne connait pas encore bien ces gènes.

Les recherches récentes tendraient à démontrer que deux phénotypes "brun foncé à reflets roux" pourraient provenir de génotypes différents selon s'il est issu d'un gène pangaré, seal brown ou sooty. 

Nous avons donc terminé notre petit tour de cette génétique simplifiée des robes. Il existe encore plein d'autres gènes pas forcément encore bien mis en évidence ni bien compris et d'autres encore que nous n'avons pas découvert...

Génétique équine: les robes, gènes Pie et Apaloosa

Contrairement à ce que l'on pense parfois, il n'y existe pas qu'un seul gène pie mais plusieurs. Chaque gène définit la manière dont va se répartir le blanc sur le corps du cheval (c'est ce qu'on appelle le patron ou patern en anglais). 

On dénombre à ce jour 4 gènes pie différents (tobiano, overo, sabino et splash white) qui peuvent être présents seuls ou de manière combinée. Les gènes pie peuvent fonctionner avec toutes les couleurs de robes (à ma connaissance).

11) Gène Tobiano

On le note T. C'est un gène dominant. 

Chez le cheval tobiano, le blanc traverse la ligne du dos et est distribué sur au moins un flanc. La queue peut être bicolore et le bord des tâches blanches est net. Les yeux sont foncés.

Source

Il peut y avoir autant de blanc que de couleur, la même quantité de chaque ou bien plus de couleur que de blanc.

12) Gène Sabino

Source

On le note Sb1. C'est un gène semi dominant: selon s'il y a un ou deux allèles Sb1, le patron de la robe sera différent (avec deux allèles Sb1, on aura un cheval presque entièrement blanc).

Chez le cheval sabino, on trouve souvent une grande marque en tête et des balzanes hautes. Les tâches sont "floues" et il y a souvent un roanage. Il peut y avoir des petites tâches rondes, comme des éclaboussures disséminées dans la robe. Les yeux sont foncés.

13) Gène Splash White

Source

On le note SW. C'est un gène semi dominant: deux allèles SW rendront le cheval plus blanc que celui qui n'a qu'un allèle.

Les membres sont blancs (balzanes plus ou moins hautes) et le blanc peut monter jusque sur le ventre mais ne traverse pas la ligne du dos. Les yeux peuvent être bleus.

14) Gène Overo

Source

On le note O. C'est un gène dominant.

Chez le cheval overo, la ligne du dos ne comporte pas de blanc, les tâches sont irrégulières et ciselées, la queue est unie et les yeux peuvent être bleus.

15) Gène Lethal White ou LWO

Un cheval overo est forcément Oo. En effet, le gène O est lié au gène Lethal White (LWO).

Le cheval overo hétérozygote (Oo) est très souvent porteur du gène LWO (on peut néanmoins tester le cheval pour le savoir mais la quasi totalité des overos sont porteurs) qui, lui, est un gène récessif (un cheval peut être porteur sans le déclarer).

On évite de croiser deux chevaux overo car on prend le risque d'obtenir un cheval qui serait OO et donc qui aurait de très fortes probabilités d'être également homozygote sur le LWO ce qui rend le cheval non viable (système digestif pas terminé). 

16) Gène Apaloosa

On connait encore mal la façon dont se créer une robe apaloosa. Plusieurs gènes entreraient en jeu ce qui permettrait de générer les différents patrons de robes que l'on peut rencontrer.

Je reste volontairement floue sur l'apaloosa car très sincèrement c'est une question que je ne maîtrise pas du tout.

Génétique équine: les robes, gènes "blanchissants"

Dans la continuité des précédents articles sur la génétique des robes, on va aujourd'hui voir les gènes qui agissent en "blanchissant" la robe.

7) Un gène particulier: le gène Gray ou Gris

Source

On le note G.

La particularité de ce gène, c'est qu'il s'applique sur n'importe quelle robe. C'est ce qui explique qu'un cheval gris soit né coloré. C'est un gène évolutif c'est à dire que le grisonnement va s'accentuer au fil des années. 

La vitesse d'évolution de la robe dépend de chaque cheval. Le grisonnement commence généralement autour des yeux (les fameuses lunettes) et de la tête puis s'étend progressivement à tout le corps. Plus le cheval vieillit, plus les poils et les crins deviennent blancs (mais la peau reste grise généralement).

Ce gène fonctionne en entraînant une dépigmentation progressive des poils et crins (de la peau aussi parfois) et est souvent associé à des problèmes type mélanomes.

Les autres gènes de dilution ne seront pas visibles sur un cheval porteur d'un ou deux G car G masque tous le reste.

Pourcentage de chances d'avoir un poulain gris selon la présence d'un ou deux G chez les parents:

8) Gène Roan ou Rouan

On le note Rn. C'est un gène dominant. Ce gène agit en ajoutant des poils blancs à l'ensemble de la robe du cheval tout en préservant la couleur sur la tête et les membres.

En règle générale, le poulain nait coloré et blanchit autour de ses deux ans. La robe n'évolue plus par la suite.

Rn peut être visible sur n'importe quelle robe.

Bay Roan / Source

Blue Roan / Source

Red Roan  / Source

9) Gène Rabicano

Alezan Rabicano / Source

On le note Rb. C'est un gène dominant. Ce gène agit d'une façon assez similaire au gène Roan à cette différence près que le blanchiment se limite aux flancs, au ventre et à la base de la queue. 

Le blanchiment peut prendre un aspect "strié" au niveau des flancs.

10) Dominant White ou Blanc Dominant

Source

On le note Dw. Avec ce gène, le cheval présente une robe blanche, une peau rose et des yeux foncés. Dw a été découvert récemment. On ne sait pas tout sur Dw si ce n'est qu'il s'agit en fait d'une mutation d'un autre gène (en lien avec le sabino, le tobiano et le roan). Au delà de la couleur, la mutation semble agir sur une partie de gène (qu'on appelle KIT) qui concerne également d'autres choses (la mise en place de certains organes du foetus par exemple). 

Cette mutation peut se transmettre de manière héréditaire mais aussi apparaitre spontanément. 

Le cheval homozygote Dw (DwDw) ne serait pas viable. Le cheval Dominant White est donc forcément Dwdw.

Génétique équine: les robes, gènes de dilution

Nous avons vu que l'alezan (ee) et le noir (EE ou Ee) sont les deux robes de base au niveau génétique. Mais alors comment obtient-on du bai? C'est ce que nous allons voir maintenant...

3) Comment obtient-on du bai? Le gène Agouti

Contrairement à ce que l'on pense souvent, le bai n'est donc pas une robe de base. C'est en fait un cheval noir (EE ou Ee) qui possède le gène Agouti (noté A). A est un gène dominant; il suffit d'un seul allèle A pour que l'agouti s'exprime et que le cheval soit bai.

Les phénotypes bais sont donc EeAA, EeAa, EEAA ou EEAa. Un Eeaa ou un EEaa sera noir car le gène A n'est pas présent. 

Un cheval ee (alezan) peut être porteur de A (Aa ou AA) mais l'alezan masque l'agouti donc visuellement le cheval sera alezan tout en ayant la possibilité de transmettre le gène Agouti.

A agit en éclaircissant le corps mais pas les extrémités ni les crins. 

C'est un gène encore mystérieux et on découvre seulement son mode de fonctionnement. Il existerait plusieurs types de gènes A qui créeraient chacun des nuances de bais différentes et seraient à l'origine du cheval "noir pangaré".

4) Le gène Crème

Il est noté Cr s'il est présent, cr s'il est absent. Si on a un allèle Cr, la robe de base sera déjà diluée et si on a deux allèles Cr, la dilution sera encore renforcée. Voici les robes que l'on obtient lorsqu'on a un gène crème sur l'alezan/le noir/le bai:

Palomino / Source

Perlino / Source

Cremello / Source

Isabelle / Source

Smocky Black / Source

Smocky Cream / Source

5) Le gène Dun

Il est noté Dn s'il est présent, dn s'il est absent. C'est un gène dominant. Qu'il y ait deux allèles Dn ne renforcerait pas l'effet de Dn même si on suppose que deux allèles Dn renforceraient les marques primitives.

Il éclaircit le corps en laissant les crins et extrémités inchangées. Il peut laisser apparaitre les marques primitives (zébrures, crins parfois bicolores, bout des oreilles foncé, croix de St André, ombres scapulaires...). Toutefois, ces marques ne sont pas forcément présentes car d'autres gènes peuvent venir les diluer. 

Voila les robes obtenues avec le gène Dn:

Red Dun / Source

Grullo / Source

Bai Dun / Source

5) Le gène Silver

Il est noté Z et ne fonctionne que sur la couleur noir (et les bais aussi forcément) en l'éclaircissant. C'est un gène dominant mais le cheval homozygote sur Z verra les caractéristiques de Z renforcées.

Il fonctionne en éclaircissant l'ensemble du cheval mais plus particulièrement les crins, les fanons et les cils.

Attention! Un cheval Silver Bay (robe de base noire) est visuellement très proche d'un cheval Alezan avec un gène Flaxen (robe de base alezane) En France, les deux seraient appelés Alezans crins lavés alors que le premier devrait plutôt être appelé Bai crins lavés.

Chocolate / Source

Silver Bay / Source

6) Le gène Champagne

Il est noté Ch. C'est un gène dominant. Il éclaircit les poils et les crins en beige et donne une peau rosée/lavande et mouchetée. Il crée des robes évolutives dont la teinte s'éclaircit avec le temps. A la naissance, la peau est rose et les yeux sont bleus; en grandissant, la peau prend des mouchetures et les yeux deviennent verts à ambre. La robe d'hiver du cheval Ch fonce en hiver et on voit souvent des pommelures inversées.

Gold / Source

Amber / Source

Brown / Source

Génétique équine: les robes, définitions et robes de base

Je m'attelle enfin à une série d'articles (parce que je pense que je serai obligée d'en faire plusieurs vu comme le sujet est vaste...) sur la génétique équine et plus précisément sur les mystères des robes.

Comme bien souvent lorsqu'on cherche des infos concernant des sujets un peu scientifiques (et encore plus quand il s'agit de sciences animales), on se rend vite compte qu'en France ba on est un peu largués et en retard comparé à d'autres nations...

En matière de classification des robes, par exemple, il y a 20 ans, quand j'ai passé mon premier galop, on apprenait le fameux BANC, BIS, GAL, R, P:

- les robes simples: Blanc, Alezan, Noir, Café au lait

- les robes composées de deux couleurs séparées : Bai, Isabelle, Souris

- les robes composées de deux couleurs mélangées: Gris, Aubère, Louvet

- les robes composées de trois couleurs mélangées: Rouan

- les robes composées de deux plaques de couleurs: Pie

Hmmmm... le doux parfum d'antan

Pour compléter le descriptif de la robe d'un cheval, on avait quelques particularités:

- les pommelures

- la raie de mulet

- les zébrures sur les membres (et encore je suis même pas sûre que les HN utilisaient ce terme)

- les balzanes et les marques en tête

A l'époque, ça suffisait amplement car la plupart des chevaux étaient vétus de robes classiques (alezans, bais, gris); croiser un aubère ou un louvet était rarissime! Et puis, avec le développement de l'équitation de loisir, on a vu apparaitre de plus en plus de chevaux aux robes bizarres, impossibles à caser dans la classification des HN. Les Haras Nationaux (cette fabuleuse institution quelque peu vieillissante et conservatrice) ont alors révisé leur classification (en 1999) afin de pouvoir décrire ces nouvelles robes. Depuis, c'est un peu du grand n'importe quoi et on se retrouve avec des chevaux qu'on ne sait toujours pas classifier parce que, malgré tous les efforts entrepris pour dépoussiérer notre vieille classification, le descriptif de la robe du cheval est toujours basé sur une observation visuelle du cheval.

Les américains, au contraire, tiennent plus compte de la génétique du cheval. Il y a donc énormément de robes différentes mais la nomenclature est plus juste d'un point de vue génétique.

Pour donner un exemple rapide, chez nous, un cheval anciennement "bai brun foncé" est maintenant "noir pangaré" sauf que la génétique conduisant à produire ce visuel de "noir pangaré" peut être différente d'un cheval à l'autre. Donc il semble erroné de donner à ces deux chevaux le même nom de robe alors qu'elles sont génétiquement différentes...

On va donc tenter de décrypter un peu tout ça...

1) Comment se transmet l'information génétique?

Les différentes caractéristiques d'un individu (couleur de la robe, couleur des yeux...) sont codifiées par les gènes. Chaque gène porte sur une seule caractéristique. Les gènes sont portés par l'ADN.

L'ADN de l'individu (ce qui crée les cellules) est composé de chromosomes. Chaque chromosome porte deux allèles. Ce sont eux qui vont déterminer si le caractère du gène concerné va s'exprimer (être visible) ou pas.

Pour chaque gène, il y a deux allèles. Chacun des parents transmet un seul allèle. C'est comme ça que le petit obtient ses deux allèles. 

Techniquement, chaque allèle est représenté par une lettre. Si l'allèle autorise le gène à s'exprimer, on notera la lettre en majuscule. Si l'allèle n'autorise pas le gène à s'exprimer, on notera la lettre en minuscule.

Comme chaque gène est codifié par deux allèles, deux lettres seront nécessaires pour décrire chaque gène. 

Je me souviens d'un site où ils expliquaient à travers l'exemple d'un gène qui codifierait si le petit est une licorne ou pas (je n'arrive pas à retrouver ce site, si quelqu'un le connait...) donc je vais reprendre cet exemple pour rendre les choses simples.

Admettons que le gène LI indique si l'individu est une licorne ou pas.

Si on a un parent qui est LI/LI (donc "oui" et "oui" pour les deux allèles du gène), il sera visiblement licorne. L'autre parent est Li/Li (donc "non" et "non" pour les deux allèles du gène), il sera visiblement cheval sans corne.

Chaque parent va donner un allèle donc le petit sera forcément LI/Li. 

On dit qu'il est porteur du gène LI mais est-ce que ça veut dire qu'il sera forcément une licorne?

Ca dépend... Si le gène LI est un gène dominant alors à partir du moment où le petit aura un seul "oui" (LI en majuscules), il sera automatiquement licorne car l'allèle LI "écrasera" l'allèle Li.

En revanche, si le gène LI est un gène récessif, il faudra nécessairement deux allèles LI pour que le gène s'exprime. Si on a juste un seul LI, le poulain ne sera pas licorne.

Quand on a deux allèles "oui" (LI/LI), le poulain sera dit homozygote sur le gène LI.

Quand on a un seul allèle "oui" (LI/Li) le poulain sera dit hétérozygote sur le gène LI.

Admettons maintenant que l'on croise une jument LI/Li avec un étalon Li/Li...

• Si LI est un gène dominant: la jument est licorne, l'étalon est cheval.

Le croisement des deux donnera 4 possibilités pour le poulain:

On a 50% de chances d'avoir un poulain LI/Li et 50% de chance d'avoir un poulain Li/Li.

Comme LI est dominant, le poulain LI/Li sera licorne. Le poulain Li/Li sera forcément cheval sans corne.

• Si LI est un gène récessif, le poulain LI/Li n'aura pas de corne car il faut nécessairement deux LI pour que le gène puisse s'exprimer. 

De même si LI est récessif, si on croise une jument LI/Li (donc non licorne) avec un étalon LI/Li (donc non licorne), on aura les possibilités suivantes:

On a 50% de chance d'avoir un LI/Li => poulain sans corne mais hétérozydote sur le gène LI, 25% de chances d'avoir un LI/LI => poulain licorne homozigote sur le gène LI et 25% de chances d'avoir un Li/Li => non licorne et non porteur du gène LI.

2) Les robes de base: l'alezan et le noir

Contrairement à ce que l'on pourrait croire, génétiquement, il n'y a que deux robes de base: l'alezan et le noir. A partir de ces deux robes, on peut créer toutes les autres.

Ces deux robes de base sont codifiées par le gène Extension noté E. Ce gène indique la présence (ou l'absence) d'un pigment, l'eumélanine.
E est dominant donc Ee et EE donneront une robe noire alors que ee donnera une robe alezane.

Si on croise un entier EE (noir) avec une jument ee (alezane), on aura 100% de chances d'avoir un poulain Ee donc visuellement noir. 

Si on croise un entier Ee (noir) et une jument ee (alezane), on aura 50% de chances d'avoir un poulain ee (alezan) et 50% de chances d'avoir un poulain Ee (noir). Deux chevaux alezans donneront un poulain alezan.

Deux chevaux noirs donneront un cheval noir mais qui pourra être hétérozygote (Ee). Ce cheval croisé avec un alezan ou un autre cheval Ee pourra donner un poulain alezan. 

On peut donc avoir deux parents visuellement noirs (tous les deux hétérozygotes donc Ee) qui donnent un poulain alezan (ee)!